সংক্ষিপ্ত উত্তর: জেনারেটিভ এআই প্রধানত সম্ভাব্য অণু বা প্রোটিন সিকোয়েন্স তৈরি করে, সংশ্লেষণের পথ প্রস্তাব করে এবং পরীক্ষাযোগ্য অনুমান তুলে ধরে প্রাথমিক ঔষধ আবিষ্কার প্রক্রিয়াকে ত্বরান্বিত করে, ফলে গবেষণা দলগুলোকে কম সংখ্যক “অন্ধ” পরীক্ষা চালাতে হয়। কঠোর সীমাবদ্ধতা আরোপ করা হলে এবং আউটপুট যাচাই করা হলে এটি সবচেয়ে ভালো কাজ করে; একে দৈববাণীর মতো ব্যবহার করলে এটি আত্মবিশ্বাসের সাথে বিভ্রান্ত করতে পারে।
মূল বিষয়গুলি:
ত্বরণ: ধারণা তৈরির প্রসার বাড়াতে GenAI ব্যবহার করুন, তারপর কঠোর ফিল্টারিং দিয়ে সংকুচিত করুন।
সীমাবদ্ধতা: প্রজন্মের আগে সম্পত্তির পরিসর, স্ক্যাফোল্ড নিয়ম এবং নতুনত্বের সীমা প্রয়োজন।
যাচাইকরণ: আউটপুটগুলিকে অনুমান হিসাবে বিবেচনা করুন; অ্যাসেস এবং অর্থোগোনাল মডেল দিয়ে নিশ্চিত করুন।
ট্রেসেবিলিটি: লগ প্রম্পট, আউটপুট এবং যুক্তি যাতে সিদ্ধান্তগুলি নিরীক্ষণযোগ্য এবং পর্যালোচনাযোগ্য থাকে।
অপব্যবহার প্রতিরোধ: শাসন, অ্যাক্সেস নিয়ন্ত্রণ এবং মানব পর্যালোচনার মাধ্যমে ফাঁস এবং অতিরিক্ত আত্মবিশ্বাস রোধ করুন।

এর পরে আপনি যে প্রবন্ধগুলি পড়তে পছন্দ করতে পারেন:
🔗 স্বাস্থ্যসেবায় কৃত্রিম বুদ্ধিমত্তার ভূমিকা
কীভাবে AI রোগ নির্ণয়, কর্মপ্রবাহ, রোগীর যত্ন এবং ফলাফল উন্নত করে।.
🔗 এআই কি রেডিওলজিস্টদের প্রতিস্থাপন করবে?
অটোমেশন কীভাবে রেডিওলজি বৃদ্ধি করে এবং কী মানুষের মধ্যে থাকে তা অন্বেষণ করে।.
🔗 কৃত্রিম বুদ্ধিমত্তা কি ডাক্তারদের স্থান দখল করবে?
ডাক্তারদের চাকরি এবং অনুশীলনের উপর AI-এর প্রভাব সম্পর্কে সৎ দৃষ্টিভঙ্গি।.
🔗 বৈজ্ঞানিক আবিষ্কারের জন্য সেরা এআই ল্যাব টুল
পরীক্ষা-নিরীক্ষা, বিশ্লেষণ এবং আবিষ্কারকে ত্বরান্বিত করার জন্য সেরা এআই ল্যাব টুল।.
এক নিঃশ্বাসে ওষুধ আবিষ্কারে জেনারেটিভ এআই-এর ভূমিকা 😮💨
জেনারেটিভ এআই ওষুধ দলগুলোকে সম্ভাব্য অণু তৈরি করতে , বৈশিষ্ট্য ভবিষ্যদ্বাণী করতে, পরিবর্তনের পরামর্শ দিতে, সংশ্লেষণের পথ প্রস্তাব করতে, জৈবিক অনুমান অন্বেষণ করতে এবং পুনরাবৃত্তির চক্র সংকুচিত করতে সাহায্য করে — বিশেষ করে প্রাথমিক আবিষ্কার এবং লিড অপটিমাইজেশনের পর্যায়ে। নেচার ২০২৩ (লিগ্যান্ড আবিষ্কার পর্যালোচনা), এলসেভিয়ার ২০২৪ পর্যালোচনা (ডি নভো ড্রাগ ডিজাইনে জেনারেটিভ মডেল)।
এবং হ্যাঁ, এটি আত্মবিশ্বাসের সাথে অর্থহীন কথাবার্তাও তৈরি করতে পারে। এটাই তো স্বাভাবিক। ঠিক যেন রকেট ইঞ্জিন হাতে পাওয়া এক অতি উৎসাহী ইন্টার্নের মতো। চিকিৎসকদের নির্দেশিকা (বিভ্রমের ঝুঁকি) এনপিজে ডিজিটাল মেডিসিন ২০২৫ (বিভ্রম + সুরক্ষা কাঠামো)
কেন এটা মানুষের স্বীকার করার চেয়েও বেশি গুরুত্বপূর্ণ 💥
আবিষ্কারের অনেক কাজই হলো “অনুসন্ধান”। রাসায়নিক জগৎ অনুসন্ধান, জীববিজ্ঞান অনুসন্ধান, সাহিত্য অনুসন্ধান, গঠন-কার্যকারিতা সম্পর্ক অনুসন্ধান। সমস্যা হলো, রাসায়নিক জগৎ… মূলত অসীমের কাছাকাছি। Accounts of Chemical Research 2015 (রাসায়নিক জগৎ) Irwin & Shoichet 2009 (রাসায়নিক জগতের মাপকাঠি)
"যুক্তিসঙ্গত" বৈচিত্র্যের চেষ্টা করে আপনি একাধিক জীবন কাটিয়ে দিতে পারেন।.
জেনারেটিভ এআই কর্মপ্রবাহকে এখান থেকে স্থানান্তর করে:
-
"আসুন আমরা কী ভাবতে পারি তা পরীক্ষা করে দেখি"
থেকে:
-
"আসুন আমরা আরও বৃহত্তর, স্মার্ট বিকল্পগুলির একটি সেট তৈরি করি, তারপর সেরাগুলি পরীক্ষা করি"
পরীক্ষা-নিরীক্ষা বাদ দেওয়াটা মূল বিষয় নয়। বরং আরও ভালো পরীক্ষা-নিরীক্ষা বেছে নেওয়াই। 🧠 নেচার ২০২৩ (লিগ্যান্ড আবিষ্কার পর্যালোচনা)
এছাড়াও, এবং এই বিষয়টি নিয়ে তেমন আলোচনা হয় না, এটি বিভিন্ন শাখার দলগুলোকে একে অপরের সাথে কথা বলতে। রসায়নবিদ, জীববিজ্ঞানী, DMPK বিশেষজ্ঞ, কম্পিউটার বিজ্ঞানী… প্রত্যেকেরই নিজস্ব ভিন্ন ভিন্ন ধারণা রয়েছে। একটি ভালো মানের জেনারেটিভ সিস্টেম একটি সম্মিলিত স্কেচপ্যাড হিসেবে কাজ করতে পারে। ফ্রন্টিয়ার্স ইন ড্রাগ ডিসকভারি ২০২৪ পর্যালোচনা।
ওষুধ আবিষ্কারের জন্য জেনারেটিভ এআই-এর একটি ভালো সংস্করণ কী? ✅
সব জেনারেটিভ এআই একরকম হয় না। এই ক্ষেত্রের জন্য একটি “ভালো” সংস্করণ বলতে চাকচিক্যপূর্ণ ডেমোর চেয়ে সাদামাটা নির্ভরযোগ্যতাকেই বেশি বোঝায় (এখানে সাদামাটা হওয়াটাই একটি গুণ)। নেচার ২০২৩ (লিগ্যান্ড আবিষ্কার পর্যালোচনা)
একটি ভালো জেনারেটিভ এআই সেটআপে সাধারণত থাকে:
-
ডোমেইন গ্রাউন্ডিং: রাসায়নিক, জৈবিক এবং ফার্মাকোলজিক্যাল ডেটার সাথে প্রশিক্ষিত বা অভিযোজিত (শুধু সাধারণ টেক্সট নয়) 🧬 এলসেভিয়ার ২০২৪ রিভিউ (জেনারেটিভ মডেল)
-
সীমাবদ্ধতা-প্রথম প্রজন্ম: এটি লিপোফিলিসিটি পরিসীমা, স্ক্যাফোল্ড সীমাবদ্ধতা, বাইন্ডিং সাইটের বৈশিষ্ট্য, সিলেক্টিভিটি লক্ষ্যের মতো নিয়ম মেনে চলতে পারে JCIM 2024 (ডি নভো ড্রাগ ডিজাইনে ডিফিউশন মডেল) REINVENT 4 (ওপেন ফ্রেমওয়ার্ক)
-
বৈশিষ্ট্য সচেতনতা: এটি এমন অণু তৈরি করে যা কেবল অভিনবই নয়, ADMET-এর পরিভাষায় “অযৌক্তিকও নয়” ADMETlab 2.0 (কেন প্রাথমিক ADMET গুরুত্বপূর্ণ)
-
অনিশ্চয়তা প্রতিবেদন: এটি নির্দেশ করে কখন এটি অনুমাননির্ভর এবং কখন এটি সুদৃঢ় (এমনকি একটি স্থূল আস্থা পরিসরও সহায়ক) ওইসিডি কিউএসএআর বৈধতা নীতিমালা (প্রযোজ্যতার ক্ষেত্র)
-
মানুষের-ইন-দ্য-লুপ নিয়ন্ত্রণ: রসায়নবিদরা দ্রুত আউটপুট পরিচালনা, প্রত্যাখ্যান এবং নির্দেশিকা করতে পারেন প্রকৃতি 2023 (কর্মপ্রবাহ + আবিষ্কার প্রযুক্তি প্রসঙ্গ)
-
শনাক্তকরণযোগ্যতা: আপনি দেখতে পারবেন কেন একটি প্রস্তাবনা ঘটেছে (অন্তত আংশিকভাবে), নতুবা আপনি অন্ধকারে থাকবেন। ওইসিডি কিউএসএআর নির্দেশিকা (মডেলের স্বচ্ছতা + বৈধতা)
-
মূল্যায়ন হারনেস: ডকিং, কিউএসএআর, ফিল্টার, রেট্রোসিন্থেসিস চেক - সবই সংযুক্ত 🔧 নেচার ২০২৩ (লিগ্যান্ড আবিষ্কার পর্যালোচনা) সিএএসপি-তে মেশিন লার্নিং (কোলি ২০১৮)
-
পক্ষপাত এবং তথ্য ফাঁসের নিয়ন্ত্রণ: প্রশিক্ষণ ডেটা মুখস্থ করার প্রবণতা যাতে গোপনে ঢুকে না পড়ে (হ্যাঁ, এমনটা ঘটে) ইউএসএনআইএক্স ২০২১ (প্রশিক্ষণ ডেটা নিষ্কাশন) ভোগট ২০২৩ (নতুনত্ব/অনন্যতা সংক্রান্ত উদ্বেগ)
যদি তোমার জেনারেটিভ এআই সীমাবদ্ধতাগুলি সামলাতে না পারে, তাহলে এটি মূলত একটি নতুনত্ব জেনারেটর। পার্টিতে মজা। ড্রাগ প্রোগ্রামে কম মজা।.
যেখানে জেনারেটিভ এআই ওষুধ আবিষ্কারের পাইপলাইন জুড়ে ফিট করে 🧭
এখানে একটি সহজ মানসিক রূপরেখা দেওয়া হলো। জেনারেটিভ এআই প্রায় প্রতিটি পর্যায়েই অবদান রাখতে পারে, কিন্তু এটি সেখানেই সবচেয়ে ভালো কাজ করে যেখানে পুনরাবৃত্তি ব্যয়বহুল এবং অনুমানের পরিসর বিশাল। নেচার ২০২৩ (লিগ্যান্ড আবিষ্কার পর্যালোচনা)
সাধারণ স্পর্শবিন্দু:
-
লক্ষ্য আবিষ্কার এবং বৈধতা (অনুমান, পথ ম্যাপিং, বায়োমার্কার পরামর্শ) ড্রাগ আবিষ্কারের ফ্রন্টিয়ার্স 2024 পর্যালোচনা
-
হিট আইডেন্টিফিকেশন (ভার্চুয়াল স্ক্রিনিং অগমেন্টেশন, নতুন করে হিট জেনারেশন) নেচার বায়োটেকনোলজি ২০১৯ (GENTRL)
-
লিড অপ্টিমাইজেশন (অ্যানালগ, মাল্টি-প্যারামিটার টিউনিং সুপারিশ) REINVENT 4
-
প্রিক্লিনিক্যাল সাপোর্ট (ADMET প্রোপার্টি ভবিষ্যদ্বাণী, মাঝে মাঝে ফর্মুলেশনের ইঙ্গিত) ADMETlab 2.0
-
সিএমসি এবং সিন্থেসিস পরিকল্পনা (রেট্রোসিন্থেসিস পরামর্শ, রুট ট্রায়েজ) AiZynthFinder 2020 Coley 2017 (কম্পিউটার-সহায়তাযুক্ত রেট্রোসিন্থেসিস)
-
জ্ঞানভিত্তিক কাজ (সাহিত্য সংশ্লেষণ, প্রতিযোগিতামূলক প্রেক্ষাপটের সারসংক্ষেপ) 📚 প্যাটার্নস ২০২৫ (ওষুধ আবিষ্কারে এলএলএম)
অনেক প্রোগ্রামে, সবচেয়ে বড় সাফল্য আসে ওয়ার্কফ্লো ইন্টিগ্রেশন, কোনো একটি মডেল “অসাধারণ” হওয়ার কারণে নয়। মডেল হলো ইঞ্জিন – আর পাইপলাইন হলো গাড়ি। নেচার ২০২৩ (লিগ্যান্ড ডিসকভারি রিভিউ)
তুলনা সারণী: ওষুধ আবিষ্কারে ব্যবহৃত জনপ্রিয় জেনারেটিভ এআই পদ্ধতি 📊
একটু অসম্পূর্ণ টেবিল, কারণ বাস্তব জীবনটা একটু অসম্পূর্ণ।.
| হাতিয়ার / পদ্ধতি | (দর্শকদের) জন্য সেরা | দামের মতো | কেন এটি কাজ করে (এবং কখন কাজ করে না) |
|---|---|---|---|
| ডি নভো অণু জেনারেটর (স্মাইলস, গ্রাফ) | মেড কেম + কম্প কেম | $$-$$$ | দ্রুত নতুন সাদৃশ্য খুঁজে বের করতে দারুণ 😎 - কিন্তু অস্থিতিশীল বেমানান জিনিস তৈরি করতে পারে REINVENT 4 GENTRL (নেচার বায়োটেক ২০১৯) |
| প্রোটিন / গঠন জেনারেটর | জীববিজ্ঞান দল, কাঠামোগত জীববিজ্ঞান | $$$ | অনুক্রম ও কাঠামো প্রস্তাব করতে সাহায্য করে - কিন্তু “বিশ্বাসযোগ্য মনে হওয়া” আর “কাজ করা” এক জিনিস নয়। আলফাফোল্ড (নেচার ২০২১) আরএফডিফিউশন (নেচার ২০২৩) |
| ডিফিউশন-স্টাইলের আণবিক নকশা | উন্নত এমএল দল | $$-$$$$ | সীমাবদ্ধতা কন্ডিশনিং এবং বৈচিত্র্যে শক্তিশালী - সেটআপটি হতে পারে… একটি সম্পূর্ণ বিষয় JCIM 2024 (ডিফিউশন মডেল) PMC 2025 ডিফিউশন রিভিউ |
| সম্পত্তি পূর্বাভাস সহ-পাইলট (QSAR + GenAI কম্বো) | ডিএমপিকে, প্রকল্প দল | $$ | বাছাই ও ক্রমবিন্যাসের জন্য ভালো - কিন্তু ধ্রুব সত্য হিসেবে গ্রহণ করলে খারাপ 😬 OECD (প্রযোজ্যতার ক্ষেত্র) ADMETlab 2.0 |
| রেট্রোসিন্থেসিস পরিকল্পনাকারী | প্রক্রিয়া রসায়ন, সিএমসি | $$-$$$ | পথের ধারণা তৈরির গতি বাড়ায় - সম্ভাব্যতা ও নিরাপত্তার জন্য এখনও মানুষের প্রয়োজন AiZynthFinder 2020 Coley 2018 (CASP) |
| মাল্টিমোডাল ল্যাব কোপাইলট (টেক্সট + অ্যাস ডেটা) | অনুবাদমূলক দল | $$$ | ডেটাসেট জুড়ে সংকেত খুঁজে বের করতে সহায়ক - ডেটা অগোছালো হলে অতি আত্মবিশ্বাসের প্রবণতা থাকে। নেচার ২০২৪ (সেল ইমেজিং-এ ব্যাচ এফেক্টস) , এনপিজে ডিজিটাল মেডিসিন ২০২৫ (বায়োটেক-এ মাল্টিমোডাল)। |
| সাহিত্য এবং অনুমান সহকারী | সবাই, বাস্তবে | $ | পড়ার সময় অনেক কমিয়ে দেয় - কিন্তু হ্যালুসিনেশন পিচ্ছিল হতে পারে, যেমন মোজা অদৃশ্য হয়ে যাওয়া। প্যাটার্নস ২০২৫ (ওষুধ আবিষ্কারে এলএলএম) চিকিৎসকদের নির্দেশিকা (হ্যালুসিনেশন) |
| কাস্টম ইন-হাউস ফাউন্ডেশন মডেল | বৃহৎ ফার্মা, সু-অর্থায়িত বায়োটেক | $$$$ | সর্বোত্তম নিয়ন্ত্রণ ও সমন্বয় - তবে নির্মাণ করা ব্যয়বহুল ও ধীরগতির (দুঃখিত, এটাই সত্যি) ফ্রন্টিয়ার্স ইন ড্রাগ ডিসকভারি ২০২৪ পর্যালোচনা |
দ্রষ্টব্য: স্কেল, গণনা, লাইসেন্সিং এবং আপনার দল "প্লাগ অ্যান্ড প্লে" চায় নাকি "চলো একটি স্পেসশিপ তৈরি করি" চায় তার উপর নির্ভর করে মূল্য ব্যাপকভাবে পরিবর্তিত হয়।
আরও ঘনিষ্ঠভাবে দেখুন: হিট ডিসকভারি এবং নতুন ডিজাইনের জন্য জেনারেটিভ এআই 🧩
এর প্রধান ব্যবহারিক ক্ষেত্রটি হলো: একেবারে গোড়া থেকে (অথবা কোনো কাঠামো থেকে) এমন সম্ভাব্য অণু তৈরি করা যা একটি নির্দিষ্ট লক্ষ্যের সাথে মেলে। নেচার বায়োটেকনোলজি ২০১৯ (GENTRL) REINVENT 4
এটি সাধারণত অনুশীলনে কীভাবে কাজ করে:
-
সীমাবদ্ধতা সংজ্ঞায়িত করুন
-
লক্ষ্য শ্রেণী, বাঁধাই পকেট আকৃতি, পরিচিত লিগ্যান্ড
-
সম্পত্তির পরিসর (দ্রাব্যতা, logP, PSA, ইত্যাদি) লিপিনস্কি (৫টি প্রসঙ্গের নিয়ম)
-
নতুনত্বের সীমাবদ্ধতা (পরিচিত আইপি জোন পরিহার করুন) 🧠 Vogt 2023 (নতুনত্ব মূল্যায়ন)
-
-
প্রার্থী তৈরি করুন
-
ভারা লাফানো
-
খণ্ড বৃদ্ধি
-
"এই মূল অংশটি সাজান" পরামর্শ
-
বহু-উদ্দেশ্যমূলক উৎপাদন (বন্ধনযোগ্য + ভেদ্য + প্রায়-অবিষাক্ত) REINVENT 4 Elsevier 2024 পর্যালোচনা (উৎপাদনশীল মডেল)
-
-
আক্রমণাত্মকভাবে ফিল্টার করুন
-
ঔষধি রসায়নের নিয়ম
-
PAINS এবং প্রতিক্রিয়াশীল গ্রুপ ফিল্টার Baell & Holloway 2010 (PAINS)
-
সংশ্লেষণযোগ্যতা পরীক্ষা AiZynthFinder 2020
-
ডকিং / স্কোরিং (অসম্পূর্ণ কিন্তু সহায়ক) প্রকৃতি 2023 (লিগ্যান্ড আবিষ্কার পর্যালোচনা)
-
-
সংশ্লেষণের জন্য একটি ছোট সেট নির্বাচন করুন
-
মানুষ এখনও বেছে নেয়, কারণ মানুষ মাঝে মাঝে বাজে গন্ধ পেতে পারে
-
অস্বস্তিকর সত্যটি হলো: এর মূল্য শুধু “নতুন অণু” নয়। এর মূল্য হলো এমন নতুন অণু যা আপনার প্রোগ্রামের সীমাবদ্ধতার জন্য উপযুক্ত। শেষের এই অংশটিই সবকিছু। নেচার ২০২৩ (লিগ্যান্ড আবিষ্কার পর্যালোচনা)
এছাড়াও, সামান্য অতিরিক্ত কথা বলা হচ্ছে: যখন ভালোভাবে কাজ করা হয়, তখন মনে হতে পারে যে আপনি এমন এক অক্লান্ত জুনিয়র রসায়নবিদ নিয়োগ করেছেন যারা কখনও ঘুমান না এবং কখনও অভিযোগ করেন না। আবার, তারা এটাও বুঝতে পারে না যে কেন একটি নির্দিষ্ট সুরক্ষা কৌশল দুঃস্বপ্ন, তাই... ভারসাম্য 😅।.
আরও ভালোভাবে দেখুন: জেনারেটিভ এআই (মাল্টি-প্যারামিটার টিউনিং) সহ লিড অপ্টিমাইজেশন 🎛️
লিড অপ্টিমাইজেশন হল সেই জায়গা যেখানে স্বপ্ন জটিল হয়ে ওঠে।.
তুমি চাও:
-
শক্তি বৃদ্ধি
-
নির্বাচনীতা বৃদ্ধি
-
বিপাকীয় স্থিতিশীলতা বৃদ্ধি
-
দ্রাব্যতা বৃদ্ধি
-
নিরাপত্তা সংকেত বন্ধ
-
"ঠিক আছে"
-
এবং এখনও সংশ্লেষণযোগ্য হতে পারে
এটি একটি চিরায়ত বহু-উদ্দেশ্যমূলক অপ্টিমাইজেশন। জেনারেটিভ এআই একটি নিখুঁত সমাধান আছে এমন ভান করার পরিবর্তে, একাধিক আপস-মীমাংসার সমাধান প্রস্তাব করার ক্ষেত্রে অসাধারণভাবে পারদর্শী । REINVENT 4 Elsevier 2024 পর্যালোচনা (জেনারেটিভ মডেল)
দলগুলি এটি ব্যবহারের ব্যবহারিক উপায়:
-
সাদৃশ্যমূলক পরামর্শ: “এমন ৩০টি ভ্যারিয়েন্ট তৈরি করুন যা ক্লিয়ারেন্স কমায় কিন্তু কার্যকারিতা বজায় রাখে।”
-
সাবস্টিটিউয়েন্ট স্ক্যানিং: ব্রুট-ফোর্স গণনার পরিবর্তে নির্দেশিত অন্বেষণ
-
স্ক্যাফোল্ড হপিং: যখন একটি কোর একটি দেয়ালে আঘাত করে (টক্স, আইপি, অথবা স্থিতিশীলতা)
-
ব্যাখ্যামূলক পরামর্শ: “এই পোলার গ্রুপটি দ্রবণীয়তা বাড়াতে পারে কিন্তু ভেদ্যতা কমিয়ে দিতে পারে” (সবসময় সঠিক না হলেও, সহায়ক)
একটি সতর্কতা: বৈশিষ্ট্য ভবিষ্যদ্বাণীকারীগুলো ভঙ্গুর হতে পারে। যদি আপনার প্রশিক্ষণ ডেটা আপনার রাসায়নিক সিরিজের সাথে না মেলে, তাহলে মডেলটি নিশ্চিতভাবে ভুল হতে পারে। মানে, মারাত্মক ভুল। এবং এতে তার কোনো দ্বিধা থাকবে না। OECD QSAR বৈধতা নীতিমালা (প্রযোজ্যতার ক্ষেত্র) উইভার ২০০৮ (QSAR-এর প্রযোজ্যতার ক্ষেত্র)
আরও ভালো করে দেখুন: ADMET, বিষাক্ততা, এবং "দয়া করে প্রোগ্রামটি বন্ধ করবেন না" স্ক্রিনিং 🧯
ADMET এমন একটি জায়গা যেখানে অনেক প্রার্থী নীরবে ব্যর্থ হন। জেনারেটিভ এআই জীববিজ্ঞানের সমাধান করে না, কিন্তু এটি পরিহারযোগ্য ভুল কমাতে পারে। ADMETlab 2.0 ওয়ারিং ২০১৫ (অংশগ্রহণকারীর সংখ্যা হ্রাস)
সাধারণ ভূমিকা:
-
বিপাকীয় দায়বদ্ধতার পূর্বাভাস (বিপাকের স্থান, ক্লিয়ারেন্স ট্রেন্ড)
-
সম্ভাব্য বিষাক্ততার মোটিফ চিহ্নিত করা (সতর্কতা, প্রতিক্রিয়াশীল মধ্যবর্তী প্রক্সি)
-
দ্রাব্যতা এবং ব্যাপ্তিযোগ্যতা পরিসীমা অনুমান করা
-
hERG ঝুঁকি কমাতে বা স্থিতিশীলতা উন্নত করতে পরিবর্তনের পরামর্শ 🧪 FDA (ICH E14/S7B প্রশ্নোত্তর) EMA (ICH E14/S7B সংক্ষিপ্ত বিবরণ)
সবচেয়ে কার্যকর প্যাটার্নটি দেখতে এরকম হতে পারে: বিকল্প প্রস্তাব করার জন্য GenAI ব্যবহার করুন, কিন্তু যাচাই করার জন্য বিশেষায়িত মডেল এবং পরীক্ষা-নিরীক্ষা ব্যবহার করুন।
জেনারেটিভ এআই হলো আইডিয়েশন ইঞ্জিন। ভ্যালিডেশন এখনও অ্যাসেসে বেঁচে আছে।.
আরও ভালো করে দেখুন: জীববিজ্ঞান এবং প্রোটিন ইঞ্জিনিয়ারিংয়ের জন্য জেনারেটিভ এআই 🧬✨
ওষুধ আবিষ্কার কেবল ছোট অণু নয়। জেনারেটিভ এআই এর জন্যও ব্যবহৃত হয়:
-
অ্যান্টিবডি সিকোয়েন্স জেনারেশন
-
অ্যাফিনিটি ম্যাচুরেশনের পরামর্শ
-
প্রোটিন স্থিতিশীলতার উন্নতি
-
এনজাইম ইঞ্জিনিয়ারিং
-
পেপটাইড থেরাপিউটিক্স অনুসন্ধান প্রোটিনএমপিএনএন (সায়েন্স ২০২২) রিভস ২০২১ (প্রোটিন ল্যাঙ্গুয়েজ মডেল)
প্রোটিন এবং সিকোয়েন্স তৈরি করা বেশ শক্তিশালী হতে পারে, কারণ সিকোয়েন্সের "ভাষা" আশ্চর্যজনকভাবে মেশিন লার্নিং (ML) পদ্ধতির সাথে ভালোভাবে খাপ খায়। কিন্তু এখানে একটি সাধারণ কথা আছে: এটি ভালোভাবে খাপ খায়… যতক্ষণ না পর্যন্ত তা আর খাপ খায় না। কারণ ইমিউনোজেনিসিটি, এক্সপ্রেশন, গ্লাইকোসিলেশন প্যাটার্ন এবং ডেভেলপেবিলিটির সীমাবদ্ধতাগুলো বেশ কঠিন হতে পারে। আলফাফোল্ড (নেচার ২০২১) প্রোটিনজেনারেটর (ন্যাট বায়োটেক ২০২৪)
তাই সেরা সেটআপগুলির মধ্যে রয়েছে:
-
ডেভেলপমেন্ট ফিল্টার
-
ইমিউনোজেনিসিটি ঝুঁকি স্কোরিং
-
উৎপাদনযোগ্যতার সীমাবদ্ধতা
-
দ্রুত পুনরাবৃত্তির জন্য ওয়েট ল্যাব লুপ 🧫
যদি আপনি এগুলো বাদ দেন, তাহলে আপনি একটি অসাধারণ সিকোয়েন্স পাবেন যা প্রযোজনায় একজন ডিভার মতো আচরণ করে।.
আরও ভালো করে দেখুন: সংশ্লেষণ পরিকল্পনা এবং রেট্রোসিন্থেসিস পরামর্শ 🧰
জেনারেটিভ এআই কেবল অণুর ধারণা নয়, রসায়ন ক্রিয়াকলাপেও প্রবেশ করছে।.
রেট্রোসিন্থেসিস পরিকল্পনাকারীরা করতে পারেন:
-
একটি লক্ষ্য যৌগের রুট প্রস্তাব করুন
-
বাণিজ্যিকভাবে উপলব্ধ শুরুর উপকরণগুলি সুপারিশ করুন
-
ধাপ গণনা বা অনুভূত সম্ভাব্যতা অনুসারে রুটগুলিকে র্যাঙ্ক করুন
-
রসায়নবিদদের “সুন্দর কিন্তু অসম্ভব” ধারণাগুলো দ্রুত বাতিল করতে সাহায্য করে AiZynthFinder 2020 Coley 2018 (CASP)
এটি বাস্তব সময় বাঁচাতে পারে, বিশেষ করে যখন আপনি অনেক প্রার্থী কাঠামো অন্বেষণ করছেন। তবুও, মানুষ এখানে অনেক গুরুত্বপূর্ণ কারণ:
-
রিএজেন্টের প্রাপ্যতা পরিবর্তন
-
নিরাপত্তা এবং স্কেল সংক্রান্ত উদ্বেগ বাস্তব
-
কিছু পদক্ষেপ কাগজে দেখতে ভালো লাগে কিন্তু বারবার ব্যর্থ হয়
রূপকটি নিখুঁত না হলেও, আমি এটি ব্যবহার করছি: রেট্রোসিন্থেসিস এআই হলো এমন একটি জিপিএস-এর মতো যা বেশিরভাগ সময়ই সঠিক পথ দেখায়, শুধু মাঝে মাঝে এটি আপনাকে একটি হ্রদের মধ্যে দিয়ে পথ দেখিয়ে দেয় এবং দাবি করে যে এটিই শর্টকাট। 🚗🌊 কোলি ২০১৭ (কম্পিউটার-সহায়তায় রেট্রোসিন্থেসিস)
ডেটা, মাল্টিমোডাল মডেল এবং ল্যাবের রূঢ় বাস্তবতা 🧾🧪
জেনারেটিভ এআই ডেটা পছন্দ করে। ল্যাবগুলি ডেটা তৈরি করে। কাগজে কলমে, এটা সহজ শোনাচ্ছে।.
হা। না।.
প্রকৃত ল্যাব তথ্য হল:
-
অসম্পূর্ণ
-
কোলাহলপূর্ণ
-
ব্যাচ এফেক্টে পরিপূর্ণ লিক এট আল. ২০১০ (ব্যাচ এফেক্ট) নেচার ২০২৪ (সেল ইমেজিং-এ ব্যাচ এফেক্ট)
-
বিভিন্ন ফর্ম্যাটে ছড়িয়ে ছিটিয়ে আছে
-
"সৃজনশীল" নামকরণের রীতিতে আশীর্বাদপ্রাপ্ত
মাল্টিমোডাল জেনারেটিভ সিস্টেমগুলি একত্রিত করতে পারে:
-
পরীক্ষার ফলাফল
-
রাসায়নিক গঠন
-
ছবি (মাইক্রোস্কোপি, হিস্টোলজি)
-
ওমিক্স (ট্রান্সক্রিপ্টমিক্স, প্রোটিওমিক্স)
-
টেক্সট (প্রোটোকল, ইএলএন, রিপোর্ট) এনপিজে ডিজিটাল মেডিসিন ২০২৫ (বায়োটেক-এ মাল্টিমোডাল) মেডিকেল ইমেজ অ্যানালাইসিস ২০২৫ (মেডিসিন-এ মাল্টিমোডাল এআই)
যখন এটি কাজ করে, তখন এটি দুর্দান্ত। আপনি অস্পষ্ট নিদর্শনগুলি উন্মোচন করতে পারেন এবং এমন পরীক্ষাগুলি প্রস্তাব করতে পারেন যা একজন বিশেষজ্ঞ মিস করতে পারেন।.
যখন এটি ব্যর্থ হয়, তখন তা নীরবে ব্যর্থ হয়। এটি সজোরে দরজা বন্ধ করে দেয় না। এটি কেবল আপনাকে একটি আত্মবিশ্বাসী ভুল সিদ্ধান্তের দিকে ঠেলে দেয়। একারণেই শাসনব্যবস্থা, বৈধতা যাচাই এবং ডোমেইন পর্যালোচনা ঐচ্ছিক নয়। চিকিৎসকদের নির্দেশিকা (বিভ্রম) এনপিজে ডিজিটাল মেডিসিন ২০২৫ (বিভ্রম + সুরক্ষা কাঠামো)
ঝুঁকি, সীমাবদ্ধতা, এবং "সাবলীল আউটপুট দ্বারা প্রতারিত হবেন না" বিভাগ ⚠️
যদি শুধু একটি জিনিস মনে রাখেন, তবে এটি মনে রাখবেন: জেনারেটিভ এআই প্ররোচনামূলক। ভুল হয়েও এটি সঠিক বলে মনে হতে পারে। চিকিৎসকদের নির্দেশিকা (বিভ্রম)
মূল ঝুঁকি:
-
বিভ্রমের কার্যপ্রণালী: বিশ্বাসযোগ্য জীববিজ্ঞান যা বাস্তব নয় চিকিৎসকদের নির্দেশিকা (বিভ্রম)
-
ডেটা লিকেজ: পরিচিত যৌগের খুব কাছাকাছি কিছু তৈরি করা ইউএসএনআইএক্স ২০২১ (প্রশিক্ষণ ডেটা নিষ্কাশন) ভোগট ২০২৩ (নতুনত্ব/অনন্যতা সংক্রান্ত উদ্বেগ)
-
অতিরিক্ত অপ্টিমাইজেশন: এমন পূর্বাভাসিত স্কোরের পিছনে ছোটা যা ইন ভিট্রোতে প্রতিফলিত হয় না নেচার ২০২৩ (লিগ্যান্ড আবিষ্কার পর্যালোচনা)
-
পক্ষপাত: প্রশিক্ষণের তথ্য নির্দিষ্ট কেমোটাইপ বা লক্ষ্যবস্তুর দিকে ঝুঁকে পড়েছে Vogt 2023 (মডেল মূল্যায়ন + পক্ষপাত/নতুনত্ব)
-
মিথ্যা নতুনত্ব: “নতুন” অণু যা আসলে তুচ্ছ রূপান্তর Vogt 2023
-
ব্যাখ্যাযোগ্যতার ব্যবধান: স্টেকহোল্ডারদের কাছে সিদ্ধান্তগুলিকে ন্যায্যতা দেওয়া কঠিন OECD QSAR বৈধতা নীতিমালা
-
নিরাপত্তা ও মেধাস্বত্ব সংক্রান্ত উদ্বেগ: প্রম্পটে সংবেদনশীল প্রোগ্রামের বিবরণ 😬 ইউএসএনআইএক্স ২০২১ (প্রশিক্ষণ ডেটা নিষ্কাশন)
প্রশমন যা বাস্তবে সাহায্য করে:
-
মানুষকে সিদ্ধান্তের চক্রের মধ্যে রাখুন
-
ট্রেসেবিলিটির জন্য লগ প্রম্পট এবং আউটপুট
-
অর্থোগোনাল পদ্ধতি (পরীক্ষা, বিকল্প মডেল) দিয়ে যাচাই করুন
-
স্বয়ংক্রিয়ভাবে সীমাবদ্ধতা এবং ফিল্টার প্রয়োগ করে
-
ফলাফলগুলিকে সত্য ট্যাবলেট নয়, অনুমান হিসাবে বিবেচনা করুন OECD QSAR নির্দেশিকা
জেনারেটিভ এআই হলো একটি পাওয়ার টুল। পাওয়ার টুল আপনাকে কাঠমিস্ত্রি বানাবে না... যদি আপনি না জানেন যে আপনি কী করছেন, তাহলে তারা দ্রুত ভুল করে।.
দলগুলি কীভাবে বিশৃঙ্খলা ছাড়াই জেনারেটিভ এআই গ্রহণ করে 🧩🛠️
দলগুলি প্রায়শই সংস্থাটিকে বিজ্ঞান মেলায় রূপান্তরিত না করে এটি ব্যবহার করতে চায়। একটি ব্যবহারিক গ্রহণের পথটি এরকম দেখাচ্ছে:
-
একটি বাধা দিয়ে শুরু করুন (হিট এক্সপেনশন, অ্যানালগ জেনারেশন, সাহিত্য ট্রায়াজ) প্রকৃতি 2023 (লিগ্যান্ড আবিষ্কার পর্যালোচনা)
-
একটি সুসংহত মূল্যায়ন প্রক্রিয়া তৈরি করুন (ফিল্টার + ডকিং + প্রপার্টি চেক + কেমিক্যাল রিভিউ) REINVENT 4 AiZynthFinder 2020
-
ফলাফল পরিমাপ করুন (সময় সাশ্রয়, আঘাতের হার, ক্ষয় হ্রাস) ওয়ারিং ২০১৫ (ক্ষয়)
-
বিদ্যমান সরঞ্জামগুলির সাথে একীভূত করুন (ELN, যৌগিক রেজিস্ট্রি, অ্যাসে ডাটাবেস) এডিনবার্গ ELN রিসোর্স
-
ব্যবহারের নিয়ম তৈরি করুন (কী প্রম্পট করা যেতে পারে, কী অফলাইনে থাকে, পদক্ষেপগুলি পর্যালোচনা করুন) USENIX 2021 (ডেটা নিষ্কাশনের ঝুঁকি)
-
মানুষকে নম্রভাবে প্রশিক্ষণ দিন (সত্যিই, বেশিরভাগ ভুল অপব্যবহার থেকে হয়, মডেল থেকে নয়) চিকিৎসকদের নির্দেশিকা (বিভ্রম)
আর, সংস্কৃতিকে অবমূল্যায়ন করো না। যদি রসায়নবিদরা মনে করেন যে কৃত্রিম বুদ্ধিমত্তা তাদের উপর চাপিয়ে দেওয়া হচ্ছে, তাহলে তারা তা উপেক্ষা করবে। যদি এটি তাদের সময় বাঁচায় এবং তাদের দক্ষতাকে সম্মান করে, তাহলে তারা দ্রুত এটি গ্রহণ করবে। মানুষ এমনই মজার 🙂।.
জুম আউট করার সময় ড্রাগ আবিষ্কারে জেনারেটিভ এআই-এর ভূমিকা কী? 🔭
বৃহত্তর প্রেক্ষাপটে, ভূমিকাটি “বিজ্ঞানীদের প্রতিস্থাপন করা” নয়, বরং “বৈজ্ঞানিক পরিধি প্রসারিত করা”। নেচার ২০২৩ (লিগ্যান্ড আবিষ্কার পর্যালোচনা)
এটি দলগুলিকে সাহায্য করে:
-
প্রতি সপ্তাহে আরও অনুমান অন্বেষণ করুন
-
প্রতি চক্রে আরও প্রার্থী কাঠামো প্রস্তাব করুন
-
আরও বুদ্ধিমত্তার সাথে পরীক্ষাগুলিকে অগ্রাধিকার দিন
-
নকশা এবং পরীক্ষার মধ্যে পুনরাবৃত্তি লুপগুলি সংকুচিত করুন
-
সাইলো জুড়ে জ্ঞান ভাগাভাগি করুন প্যাটার্নস ২০২৫ (ড্রাগ আবিষ্কারে এলএলএম)
আর হয়তো সবচেয়ে অবমূল্যায়িত বিষয়: এটি আপনাকে বারবার কাজে ব্যয়বহুল মানুষের সৃজনশীলতা নষ্ট না করতে সাহায্য করে। মানুষের উচিত মেকানিজম, কৌশল এবং ব্যাখ্যা সম্পর্কে চিন্তা করা - হাতে হাতে বৈকল্পিক তালিকা তৈরি করে দিন নষ্ট না করে। প্রকৃতি ২০২৩ (লিগ্যান্ড আবিষ্কার পর্যালোচনা)
হ্যাঁ, ড্রাগ ডিসকভারিতে জেনারেটিভ এআই-এর ভূমিকা একটি অ্যাক্সিলারেটর, একটি জেনারেটর, একটি ফিল্টার এবং কখনও কখনও সমস্যা সৃষ্টিকারী। তবে এটি একটি মূল্যবান ভূমিকা।.
সমাপনী সারাংশ 🧾✅
জেনারেটিভ এআই আধুনিক ঔষধ আবিষ্কারের একটি মূল সক্ষমতা হয়ে উঠছে, কারণ এটি মানুষের চেয়ে দ্রুত অণু, অনুমান, ক্রম এবং পথ তৈরি করতে পারে - এবং এটি দলগুলোকে আরও ভালো পরীক্ষা বেছে নিতে সাহায্য করতে পারে। ফ্রন্টিয়ার্স ইন ড্রাগ ডিসকভারি ২০২৪ পর্যালোচনা নেচার ২০২৩ (লিগ্যান্ড আবিষ্কার পর্যালোচনা)
সারাংশ বুলেট:
-
এটি প্রাথমিক আবিষ্কার এবং লিড অপ্টিমাইজেশন লুপের জন্য সবচেয়ে ভালো ⚙️ REINVENT 4
-
এটি ক্ষুদ্র অণু এবং বায়োলজিক্সকে GENTRL (নেচার বায়োটেক ২০১৯) ProteinMPNN (সায়েন্স ২০২২)
-
এটি আইডিয়া ফানেলকে প্রশস্ত করে উৎপাদনশীলতা বৃদ্ধি করে Nature 2023 (লিগ্যান্ড আবিষ্কার পর্যালোচনা)
-
আত্মবিশ্বাসী অর্থহীনতা এড়াতে এর জন্য সীমাবদ্ধতা, বৈধতা এবং মানুষের প্রয়োজন OECD QSAR নীতিমালা চিকিৎসকদের নির্দেশিকা (বিভ্রম)
-
সবচেয়ে বড় জয় আসে ওয়ার্কফ্লো ইন্টিগ্রেশন, মার্কেটিং থেকে নয় Nature 2023 (ligand discovery review)
যদি আপনি এটিকে দৈববাণীর উৎস হিসেবে নয়, বরং একজন সহযোগীর মতো ব্যবহার করেন, তবে এটি সত্যিই প্রোগ্রামগুলোকে এগিয়ে নিয়ে যেতে পারে। আর যদি আপনি এটিকে দৈববাণীর উৎসের মতো ব্যবহার করেন… তাহলে, আপনি হয়তো আবারও সেই জিপিএস অনুসরণ করে হ্রদে গিয়ে পড়বেন।.
বাস্তব উদাহরণ: কনস্ট্রেইন্ট-ফার্স্ট মলিকিউল জেনারেশন ওয়ার্কফ্লো তৈরি করা 🧪
দৃশ্যকল্প
একটি কাল্পনিক কিন্তু বাস্তবসম্মত ছোট বায়োটেক দল একটি প্রদাহজনিত রোগের লক্ষ্যবস্তু নিয়ে কাজ করছে। স্ক্রিনিংয়ের মাধ্যমে তারা ইতিমধ্যে ৪২টি নিশ্চিত দুর্বল ফলাফল পেয়েছে, কিন্তু সেগুলোর বেশিরভাগেরই দ্রবণীয়তা কম এবং কয়েকটি প্রতিযোগী সংস্থার পেটেন্ট এলাকার খুব কাছাকাছি অবস্থিত।.
একটি জেনারেটিভ মডেলকে "আরও ভালো অণু খুঁজে বের করতে" বলার পরিবর্তে—যা মূলত চমৎকার অর্থহীন কিছু পাওয়ারই একটি আমন্ত্রণ—দলটি হিট এক্সপ্যানশনের জন্য একটি সুসংহত কর্মপ্রবাহ তৈরি করে।.
লক্ষ্যটি সহজ: আরও বিস্তৃত পরিসরের সাদৃশ্যপূর্ণ উপাদান তৈরি করা, সেগুলোকে কঠোরভাবে বাছাই করা, এবং শুধুমাত্র সবচেয়ে গ্রহণযোগ্য প্রার্থীগুলোকে ভেষজ রসায়ন পর্যালোচনার জন্য পাঠানো।.
সহকারীর যা প্রয়োজন
দলটি সিস্টেমটিকে দেয়:
লক্ষ্য প্রোফাইল এবং পরিচিত লিগ্যান্ড তথ্য
নিশ্চিতভাবে ক্ষতিগ্রস্ত ৪২টি স্থাপনা
আণবিক ওজন, লগপি, টিপিএসএ, দ্রবণীয়তা এবং পূর্বাভাসিত ক্লিয়ারেন্সের জন্য বৈশিষ্ট্য সীমা
আইপি পরিহারের জন্য অবরুদ্ধ স্ক্যাফোল্ড এবং সাদৃশ্য থ্রেশহোল্ড
PAINS এবং প্রতিক্রিয়াশীল গ্রুপ ফিল্টার Baell & Holloway 2010
ADMET পূর্বাভাস ADMETlab 2.0 চেক করে
রেট্রোসিন্থেসিস সম্ভাব্যতা যাচাই AiZynthFinder 2020
চূড়ান্ত নির্বাচনের জন্য মানব পর্যালোচনার নিয়মাবলী
গুরুত্বপূর্ণ বিষয়টি হলো: মডেলটিকে শুধুমাত্র কার্যকারিতার জন্য অপ্টিমাইজ করার অনুমতি দেওয়া হয় না। এটিকে কার্যকারিতা, নতুনত্ব, বিকাশযোগ্যতা এবং সংশ্লেষণযোগ্যতার মধ্যে ভারসাম্য বজায় রাখতে হয়।.
উদাহরণ নির্দেশাবলী
এই নিশ্চিত হিট স্ট্রাকচারগুলোর উপর ভিত্তি করে ১৫০টি অ্যানালগ ধারণা তৈরি করুন। আণবিক ওজন ৩০০ থেকে ৪৮০-এর মধ্যে, পূর্বাভাসিত logP ১.৫ থেকে ৪.০-এর মধ্যে, TPSA ১১০-এর নিচে রাখুন এবং IP ফাইলে তালিকাভুক্ত ব্লক করা স্কাফোল্ডগুলো এড়িয়ে চলুন। যেসব স্ট্রাকচারে কোনো PAINS অ্যালার্ট নেই, কোনো সুস্পষ্ট প্রতিক্রিয়াশীল গ্রুপ নেই এবং পাঁচ বা তার কম ধাপের একটি বিশ্বাসযোগ্য সংশ্লেষণ পথ রয়েছে, সেগুলোকে অগ্রাধিকার দিন। প্রতিটি অণুর জন্য, প্রধান পরিবর্তন, উদ্দিষ্ট বৈশিষ্ট্যের উন্নতি, মূল ঝুঁকি এবং যৌগটি বাতিল, পর্যালোচনা বা অগ্রাধিকার দেওয়া উচিত কিনা তা ব্যাখ্যা করুন।.
কীভাবে এটি পরীক্ষা করবেন
দলটি প্রথম আউটপুটটি বিশ্বাস করে না। তারা একটি ছোট মূল্যায়ন চক্র চালায়:
উৎপন্ন অণুগুলি বৈশিষ্ট্যগত সীমাবদ্ধতা মেনে চলে কিনা তা পরীক্ষা করুন।
প্রায়-অনুরূপ এবং পরিচিত যৌগের খুব কাছাকাছি কাঠামোসমূহ অপসারণ করুন।
PAINS, প্রতিক্রিয়াশীল গ্রুপ, এবং মৌলিক ভেষজ রসায়ন ফিল্টারগুলি চালান
ADMET পূর্বাভাসগুলির তুলনা করতে একটি দ্বিতীয় সম্পত্তি মডেল চালান।
দুইজন রসায়নবিদকে স্বাধীনভাবে শীর্ষ ৩০ জন প্রার্থীকে নম্বর দিতে বলুন।
শুধুমাত্র সর্বোচ্চ স্কোরপ্রাপ্ত সংক্ষিপ্ত তালিকাটি সংশ্লেষণ আলোচনায় পাঠান।
একটি মূল্যবান পরীক্ষামূলক প্রশ্ন হলো: “এআই যদি এই অণুটি প্রস্তাব না করত, তাহলেও কি আমরা এটিকে বিবেচনা করতাম?”
যখন উত্তর ‘না’ হয়, তখন দলটি কারণ জিজ্ঞাসা করে। কখনও কখনও এর থেকে একটি ভালো নতুন ধারণা বেরিয়ে আসে। আবার কখনও কখনও তা মডেল-নির্ভর অলীক কল্পনা প্রকাশ করে।.
ফলাফল
এটি শুধুমাত্র একটি দৃষ্টান্তমূলক ফলাফল - কোনো বাস্তব কোম্পানির কেস স্টাডি নয়।.
তিনটি নমুনা হিট-এক্সপ্যানশন টাস্কের সময় পরিমাপের ভিত্তিতে, ম্যানুয়াল ওয়ার্কফ্লোতে ৬০টি অ্যানালগ আইডিয়া তৈরি ও বাছাই করতে প্রায় ৫ ঘণ্টা সময় লেগেছিল। অন্যদিকে, কনস্ট্রেইন্ট-ফার্স্ট জেনএআই ওয়ার্কফ্লো প্রায় ৫৫ মিনিটে ১৫০টি প্রাথমিক ক্যান্ডিডেট তৈরি করেছিল।.
বাছাই পর্বের পর, পূর্ণাঙ্গ স্ক্রিনিং-এর জন্য মাত্র ২৭টি প্রার্থী টিকে ছিল। তাদের মধ্যে, রসায়নবিদরা ৯টিকে গভীর পর্যালোচনার যোগ্য, ১২টিকে “আকর্ষণীয় কিন্তু ঝুঁকিপূর্ণ” এবং ৬টিকে পর্যালোচনার পর বাতিল হিসেবে চিহ্নিত করেছেন।.
এর মানে হলো, মূল্যবান ফলাফলটি “১৫০টি নতুন অণু” ছিল না। মূল্যবান ফলাফলটি ছিল ১ ঘণ্টারও কম সময়ে পর্যালোচনার যোগ্য ৯টি প্রার্থী, যার সাথে একটি সুস্পষ্ট নিরীক্ষা বিবরণী ছিল যা থেকে দেখা যায় প্রতিটি প্রার্থী কোন কোন সীমাবদ্ধতায় উত্তীর্ণ বা অনুত্তীর্ণ হয়েছে।.
একটি দল নিম্নলিখিত বিষয়গুলো পর্যবেক্ষণ করে এটি যাচাই করতে পারে:
ডিজাইন চক্র প্রতি ব্যয়িত সময়
উৎপন্ন কাঠামোর সংখ্যা
ফিল্টার দ্বারা অপসারিত শতাংশ
রসায়নবিদ গ্রহণের হার
সংশ্লেষণের জন্য নির্বাচিত প্রার্থীদের সংখ্যা
পরবর্তীতে পরীক্ষায় সংখ্যাটি সক্রিয় বলে নিশ্চিত করা হয়।
কী ভুল হতে পারে
মডেলটি প্রকৃত অর্থে সঠিক রসায়ন প্রস্তাব করার পরিবর্তে ফিল্টারগুলোকে কেন্দ্র করে অপ্টিমাইজ করতে পারে।.
একজন প্রার্থী পূর্বাভাসিত ADMET-এ চমৎকার ফল করলেও প্রকৃত পরীক্ষায় তাৎক্ষণিকভাবে ব্যর্থ হতে পারেন। OECD QSAR বৈধকরণ নীতিমালা
বিপরীত সংশ্লেষণের প্রস্তাবনাগুলো বিশ্বাসযোগ্য মনে হতে পারে, যদিও তা অনুপলব্ধ বিকারক, অস্বস্তিকর পরিস্থিতি বা অনিরাপদ রসায়নের উপর নির্ভর করে।.
নোভেলটি ফিল্টারটি হয়তো মূল্যবান যৌগগুলোকে অতিরিক্ত কঠোরভাবে অপসারণ করে ফেলে, অথবা এমন অণুগুলোকে যেতে দেয় যেগুলো এখনও জ্ঞাত আইপি-র (IP) খুব কাছাকাছি।.
সবচেয়ে বড় ভুল হলো ক্রমবিন্যস্ত তালিকাটিকে সত্য হিসেবে গণ্য করা। এটি কেবল অগ্রাধিকারপ্রাপ্ত অনুমানের একটি তালিকা।.
ব্যবহারিক শিক্ষা
ঔষধ আবিষ্কারে জেনারেটিভ এআই-এর সর্বোত্তম প্রয়োগ “বোতাম টিপলেই ঔষধ” নয়। এটি একটি নিয়ন্ত্রিত ধারণা তৈরির কারখানা: ব্যাপকভাবে ধারণা তৈরি করা, কঠোরভাবে ছেঁকে নেওয়া, প্রতিটি সিদ্ধান্ত নথিভুক্ত করা এবং বিজ্ঞানীদের চূড়ান্ত সিদ্ধান্ত নিতে দেওয়া।.
প্রায়শই জিজ্ঞাসিত প্রশ্নাবলী
ওষুধ আবিষ্কারে জেনারেটিভ এআই-এর ভূমিকা কী?
জেনারেটিভ এআই প্রাথমিকভাবে ক্যান্ডিডেট অণু, প্রোটিন সিকোয়েন্স, সংশ্লেষণ রুট এবং জৈবিক অনুমান প্রস্তাব করে প্রাথমিক আবিষ্কার এবং লিড অপ্টিমাইজেশনে ধারণার ফানেলকে প্রশস্ত করে। এর মান হল "পরীক্ষা প্রতিস্থাপন করুন" কম এবং "আরও ভালো পরীক্ষা বেছে নিন" - অনেক বিকল্প তৈরি করে এবং তারপর কঠোরভাবে ফিল্টার করে। এটি একটি সুশৃঙ্খল কর্মপ্রবাহের ভিতরে একটি অ্যাক্সিলারেটর হিসাবে সবচেয়ে ভালো কাজ করে, স্বতন্ত্র সিদ্ধান্ত গ্রহণকারী হিসাবে নয়।.
ওষুধ আবিষ্কারের পাইপলাইন জুড়ে জেনারেটিভ এআই কোথায় সবচেয়ে ভালো পারফর্ম করে?
যেখানে হাইপোথিসিসের স্থান বিশাল এবং পুনরাবৃত্তি ব্যয়বহুল, যেমন হিট আইডেন্টিফিকেশন, ডি নভো ডিজাইন এবং লিড অপ্টিমাইজেশন, সেখানে এটি সর্বাধিক মূল্য প্রদান করে। দলগুলি ADMET ট্রাইএজ, রেট্রোসিন্থেসিস পরামর্শ এবং সাহিত্য বা হাইপোথিসিস সহায়তার জন্যও এটি ব্যবহার করে। সাধারণত সবচেয়ে বড় লাভ আসে ফিল্টার, স্কোরিং এবং মানব পর্যালোচনার সাথে জেনারেশনকে একীভূত করার মাধ্যমে, একটি একক মডেলকে "স্মার্ট" হওয়ার আশা করার পরিবর্তে।
জেনারেটিভ মডেলগুলি যাতে অকেজো অণু তৈরি না করে, সেজন্য আপনি কীভাবে সীমাবদ্ধতা নির্ধারণ করবেন?
একটি বাস্তব পদ্ধতি হল প্রজন্মের আগে সীমাবদ্ধতাগুলি সংজ্ঞায়িত করা: সম্পত্তি পরিসর (যেমন দ্রাব্যতা বা লগপি লক্ষ্য), স্ক্যাফোল্ড বা সাবস্ট্রাকচার নিয়ম, বাইন্ডিং-সাইট বৈশিষ্ট্য এবং নতুনত্বের সীমা। তারপর ঔষধি রসায়ন ফিল্টার (পেইন/প্রতিক্রিয়াশীল গোষ্ঠী সহ) এবং সংশ্লেষণযোগ্যতা পরীক্ষা প্রয়োগ করুন। সীমাবদ্ধতা-প্রথম প্রজন্ম বিশেষ করে ডিফিউশন-স্টাইলের আণবিক নকশা এবং REINVENT 4 এর মতো কাঠামোর ক্ষেত্রে সহায়ক, যেখানে বহু-উদ্দেশ্যমূলক লক্ষ্যগুলি এনকোড করা যেতে পারে।.
হ্যালুসিনেশন এবং অতিরিক্ত আত্মবিশ্বাস এড়াতে দলগুলিকে কীভাবে GenAI আউটপুট যাচাই করা উচিত?
প্রতিটি আউটপুটকে একটি হাইপোথিসিস হিসেবে বিবেচনা করুন, উপসংহার নয়, এবং অ্যাসেস এবং অর্থোগোনাল মডেল দিয়ে যাচাই করুন। QSAR-স্টাইলের ভবিষ্যদ্বাণীকারীদের জন্য আক্রমণাত্মক ফিল্টারিং, ডকিং বা স্কোরিং এবং প্রযোজ্যতা-ডোমেন চেকের সাথে জেনারেশন যুক্ত করুন। সম্ভব হলে অনিশ্চয়তা দৃশ্যমান করুন, কারণ মডেলগুলি বিতরণের বাইরের রসায়ন বা নড়বড়ে জৈবিক দাবিতে আত্মবিশ্বাসের সাথে ভুল হতে পারে। হিউম্যান-ইন-দ্য-লুপ পর্যালোচনা একটি মূল সুরক্ষা বৈশিষ্ট্য হিসাবে রয়ে গেছে।.
কীভাবে আপনি ডেটা ফাঁস, আইপি ঝুঁকি এবং "মুখস্থ" আউটপুট প্রতিরোধ করতে পারেন?
গভর্নেন্স এবং অ্যাক্সেস নিয়ন্ত্রণ ব্যবহার করুন যাতে সংবেদনশীল প্রোগ্রামের বিবরণগুলি অপ্রম্পটে এবং লগ প্রম্পট/আউটপুটগুলিতে অডিটেবিলিটির জন্য এলোমেলোভাবে স্থাপন না করা হয়। নতুনত্ব এবং সাদৃশ্য পরীক্ষাগুলি কার্যকর করুন যাতে তৈরি প্রার্থীরা পরিচিত যৌগ বা সুরক্ষিত অঞ্চলের খুব কাছাকাছি না বসে। বহিরাগত সিস্টেমে কোন ডেটা অনুমোদিত তা সম্পর্কে স্পষ্ট নিয়ম রাখুন এবং উচ্চ-সংবেদনশীলতার কাজের জন্য নিয়ন্ত্রিত পরিবেশ পছন্দ করুন। মানব পর্যালোচনা "অত্যধিক পরিচিত" পরামর্শগুলি তাড়াতাড়ি ধরতে সহায়তা করে।.
লিড অপ্টিমাইজেশন এবং মাল্টি-প্যারামিটার টিউনিংয়ের জন্য জেনারেটিভ এআই কীভাবে ব্যবহার করা হয়?
লিড অপ্টিমাইজেশনে, জেনারেটিভ এআই মূল্যবান কারণ এটি একটি একক "নিখুঁত" যৌগের পিছনে না ছুটে একাধিক ট্রেডঅফ সমাধান প্রস্তাব করতে পারে। সাধারণ কর্মপ্রবাহের মধ্যে রয়েছে অ্যানালগ সাজেশন, গাইডেড সাবস্টিটিউয়েন্ট স্ক্যানিং এবং স্ক্যাফোল্ড হপিং যখন পোটেনসি, টক্স, বা আইপি সীমাবদ্ধতা অগ্রগতিতে বাধা দেয়। সম্পত্তি ভবিষ্যদ্বাণীকারী ভঙ্গুর হতে পারে, তাই দলগুলি সাধারণত একাধিক মডেল সহ প্রার্থীদের র্যাঙ্ক করে এবং তারপর পরীক্ষামূলকভাবে সেরা বিকল্পগুলি নিশ্চিত করে।.
জেনারেটিভ এআই কি জীববিজ্ঞান এবং প্রোটিন ইঞ্জিনিয়ারিংয়েও সাহায্য করতে পারে?
হ্যাঁ - দলগুলি এটি অ্যান্টিবডি সিকোয়েন্স জেনারেশন, অ্যাফিনিটি ম্যাচুরেশন ধারণা, স্থিতিশীলতা উন্নতি এবং এনজাইম বা পেপটাইড অন্বেষণের জন্য ব্যবহার করে। প্রোটিন/সিকোয়েন্স জেনারেশন বিকাশযোগ্য না হলেও যুক্তিসঙ্গত দেখাতে পারে, তাই বিকাশযোগ্যতা, ইমিউনোজেনিসিটি এবং উৎপাদনযোগ্যতা ফিল্টার প্রয়োগ করা গুরুত্বপূর্ণ। আলফাফোল্ডের মতো কাঠামোগত সরঞ্জামগুলি যুক্তি সমর্থন করতে পারে, কিন্তু "প্রশংসনীয় কাঠামো" এখনও প্রকাশ, কার্যকারিতা বা সুরক্ষার প্রমাণ নয়। ওয়েট-ল্যাব লুপগুলি অপরিহার্য।.
জেনারেটিভ এআই কীভাবে সংশ্লেষণ পরিকল্পনা এবং রেট্রোসিন্থেসিসকে সমর্থন করে?
রেট্রোসিন্থেসিস পরিকল্পনাকারীরা রুট, শুরুর উপকরণ এবং রুট র্যাঙ্কিং এর পরামর্শ দিতে পারেন যাতে ধারণা দ্রুততর হয় এবং দ্রুত অসম্ভব পথগুলি বাতিল করা যায়। রসায়নবিদদের কাছ থেকে বাস্তব-বিশ্বের সম্ভাব্যতা যাচাইয়ের সাথে AiZynthFinder-শৈলী পরিকল্পনার মতো সরঞ্জাম এবং পদ্ধতিগুলি সবচেয়ে কার্যকর হয়। প্রাপ্যতা, সুরক্ষা, স্কেল-আপ সীমাবদ্ধতা এবং "কাগজ প্রতিক্রিয়া" যা বাস্তবে ব্যর্থ হয় তার জন্য এখনও মানুষের বিচার প্রয়োজন। এইভাবে ব্যবহার করা হলে, রসায়ন সমাধানের ভান না করেই সময় সাশ্রয় হয়।.
তথ্যসূত্র
-
প্রকৃতি - লিগ্যান্ড আবিষ্কার পর্যালোচনা (২০২৩) - nature.com
-
প্রকৃতি জৈবপ্রযুক্তি - GENTRL (২০১৯) - nature.com
-
প্রকৃতি - আলফাফোল্ড (২০২১) - nature.com
-
প্রকৃতি - আরএফডিফিউশন (২০২৩) - nature.com
-
প্রকৃতি জৈবপ্রযুক্তি - প্রোটিন জেনারেটর (২০২৪) - nature.com
-
প্রকৃতি যোগাযোগ - কোষ চিত্রায়নে ব্যাচ প্রভাব (২০২৪) - nature.com
-
npj ডিজিটাল মেডিসিন - হ্যালুসিনেশন + সুরক্ষা কাঠামো (২০২৫) - nature.com
-
npj ডিজিটাল মেডিসিন - বায়োটেকের মাল্টিমোডাল (২০২৫) - nature.com
-
বিজ্ঞান - প্রোটিনMPNN (2022) - science.org
-
কোষের ধরণ - ওষুধ আবিষ্কারে এলএলএম (২০২৫) - cell.com
-
সায়েন্সডাইরেক্ট (এলসেভিয়ার) - নতুন ওষুধের নকশায় জেনারেটিভ মডেল (২০২৪) - sciencedirect.com
-
সায়েন্সডাইরেক্ট (এলসেভিয়ার) - ভোগ্ট (২০২৩): অভিনবত্ব/অনন্যতা সম্পর্কিত উদ্বেগ - sciencedirect.com
-
মেডিকেল ইমেজ অ্যানালাইসিস (সায়েন্সডাইরেক্ট) - মেডিসিনে মাল্টিমোডাল এআই (২০২৫) - sciencedirect.com
-
PubMed Central - চিকিৎসকদের নির্দেশিকা (বিভ্রমের ঝুঁকি) - nih.gov
-
রাসায়নিক গবেষণার হিসাব (ACS প্রকাশনা) - রাসায়নিক স্থান (২০১৫) - acs.org
-
PubMed Central - আরউইন ও শোইচেট (২০০৯): রাসায়নিক স্থান স্কেল - nih.gov
-
ড্রাগ আবিষ্কারের ফ্রন্টিয়ার্স (পাবমেড সেন্ট্রাল) - পর্যালোচনা (২০২৪) - nih.gov
-
জার্নাল অফ কেমিক্যাল ইনফরমেশন অ্যান্ড মডেলিং (ACS পাবলিকেশনস) - ডিফিউশন মডেল ইন ডি নভো ড্রাগ ডিজাইন (২০২৪) - acs.org
-
পাবমেড সেন্ট্রাল - রিইনভেন্ট ৪ (ওপেন ফ্রেমওয়ার্ক) - nih.gov
-
পাবমেড সেন্ট্রাল - ADMETlab 2.0 (ADMET-এর প্রাথমিক বিষয়গুলি) - nih.gov
-
OECD - (Q)SAR মডেলের নিয়ন্ত্রক উদ্দেশ্যের বৈধতার নীতিমালা - oecd.org
-
OECD - (Q)SAR মডেলের বৈধতা সংক্রান্ত নির্দেশিকা দলিল - oecd.org
-
রাসায়নিক গবেষণার হিসাব (ACS প্রকাশনা) - কম্পিউটার-সহায়ক সংশ্লেষণ পরিকল্পনা / CASP (কোলি, ২০১৮) - acs.org
-
ACS সেন্ট্রাল সায়েন্স (ACS পাবলিকেশনস) - কম্পিউটার-সহায়তাপ্রাপ্ত রেট্রোসিন্থেসিস (কোলি, ২০১৭) - acs.org
-
পাবমেড সেন্ট্রাল - আইজিন্থফাইন্ডার (২০২০) - nih.gov
-
পাবমেড - লিপিনস্কি: ৫ প্রেক্ষাপটের নিয়ম - nih.gov
-
জার্নাল অফ মেডিসিনাল কেমিস্ট্রি (এসিএস পাবলিকেশন্স) - বেল ও হলোওয়ে (২০১০): পেইনস - acs.org
-
পাবমেড - ওয়ারিং (২০১৫): অ্যাট্রিশন - nih.gov
-
PubMed - Rives (2021): প্রোটিন ভাষার মডেল - nih.gov
-
পাবমেড সেন্ট্রাল - লিক এট আল। (২০১০): ব্যাচ এফেক্টস - nih.gov
-
পাবমেড সেন্ট্রাল - ডিফিউশন পর্যালোচনা (২০২৫) - nih.gov
-
এফডিএ - E14 এবং S7B: QT/QTc ব্যবধান দীর্ঘায়ন এবং প্রোঅ্যারিথমিক সম্ভাবনার ক্লিনিকাল এবং ননক্লিনিকাল মূল্যায়ন (প্রশ্নোত্তর) - fda.gov
-
ইউরোপীয় মেডিসিন এজেন্সি - ICH নির্দেশিকা E14/S7B ওভারভিউ - europa.eu
-
USENIX - Carlini et al. (2021): ভাষা মডেল থেকে প্রশিক্ষণ তথ্য আহরণ - usenix.org
-
এডিনবরা বিশ্ববিদ্যালয় – ডিজিটাল গবেষণা পরিষেবা - ইলেকট্রনিক ল্যাব নোটবুক (ইএলএন) রিসোর্স - ed.ac.uk
-
সায়েন্সডাইরেক্ট (এলসেভিয়ার) - ওয়েভার (২০০৮): প্রযোজ্যতার QSAR ডোমেইন - sciencedirect.com